MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015387	G	6	6	19254	19259	0 %	0 %	100 %	0 %	328949559
502	NC_015387	CAC	2	6	19309	19314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949559
503	NC_015387	GCA	2	6	19338	19343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949559
504	NC_015387	T	6	6	19374	19379	0 %	100 %	0 %	0 %	328949559
505	NC_015387	G	8	8	19402	19409	0 %	0 %	100 %	0 %	328949559
506	NC_015387	TCG	2	6	19427	19432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949559
507	NC_015387	GCC	2	6	19487	19492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
508	NC_015387	AACG	2	8	19535	19542	50 %	0 %	25 %	25 %	328949559
509	NC_015387	GGC	2	6	19597	19602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949559
510	NC_015387	CAGGC	2	10	19632	19641	20 %	0 %	40 %	40 %	328949559
511	NC_015387	CAC	2	6	19705	19710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949559
512	NC_015387	GAG	2	6	19711	19716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
513	NC_015387	AGCGC	2	10	19739	19748	20 %	0 %	40 %	40 %	328949559
514	NC_015387	GCT	2	6	19777	19782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949559
515	NC_015387	TGGCC	2	10	19785	19794	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
516	NC_015387	GC	3	6	19816	19821	0 %	0 %	50 %	50 %	328949559
517	NC_015387	GGA	2	6	19826	19831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
518	NC_015387	GC	5	10	19881	19890	0 %	0 %	50 %	50 %	328949559
519	NC_015387	TTG	2	6	19997	20002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949559
520	NC_015387	AG	3	6	20026	20031	50 %	0 %	50 %	0 %	328949559
521	NC_015387	GAG	3	9	20029	20037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
522	NC_015387	TGCGC	2	10	20039	20048	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
523	NC_015387	GCC	2	6	20051	20056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
524	NC_015387	AGG	2	6	20063	20068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
525	NC_015387	GGA	2	6	20082	20087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
526	NC_015387	GGT	2	6	20110	20115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949559
527	NC_015387	CGC	2	6	20136	20141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
528	NC_015387	CG	3	6	20146	20151	0 %	0 %	50 %	50 %	328949559
529	NC_015387	G	6	6	20193	20198	0 %	0 %	100 %	0 %	328949559
530	NC_015387	TACCG	2	10	20199	20208	20 %	20 %	20 %	40 %	328949559
531	NC_015387	AGG	2	6	20219	20224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
532	NC_015387	GGA	2	6	20274	20279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
533	NC_015387	G	6	6	20292	20297	0 %	0 %	100 %	0 %	328949559
534	NC_015387	AGC	2	6	20300	20305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949559
535	NC_015387	GAG	2	6	20341	20346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
536	NC_015387	CGG	3	9	20352	20360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949559
537	NC_015387	CGTC	2	8	20378	20385	0 %	25 %	25 %	50 %	328949559
538	NC_015387	CGGT	2	8	20387	20394	0 %	25 %	50 %	25 %	328949559
539	NC_015387	GCG	2	6	20426	20431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949559
540	NC_015387	CGCTG	2	10	20448	20457	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
541	NC_015387	GAGGGC	2	12	20488	20499	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	328949559
542	NC_015387	CAG	2	6	20512	20517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949559
543	NC_015387	G	7	7	20529	20535	0 %	0 %	100 %	0 %	328949559
544	NC_015387	GCC	2	6	20551	20556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
545	NC_015387	AGG	2	6	20594	20599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949559
546	NC_015387	GCC	2	6	20605	20610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
547	NC_015387	GC	3	6	20611	20616	0 %	0 %	50 %	50 %	328949559
548	NC_015387	TGC	2	6	20621	20626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949559
549	NC_015387	GCC	2	6	20654	20659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949559
550	NC_015387	CAT	2	6	20760	20765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015387	AT	3	6	20764	20769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015387	CCG	2	6	20869	20874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949560
553	NC_015387	CGGG	2	8	20886	20893	0 %	0 %	75 %	25 %	328949560
554	NC_015387	CG	4	8	21010	21017	0 %	0 %	50 %	50 %	328949560
555	NC_015387	CTC	2	6	21025	21030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949560
556	NC_015387	CG	3	6	21069	21074	0 %	0 %	50 %	50 %	328949560
557	NC_015387	GTG	2	6	21079	21084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949560
558	NC_015387	A	6	6	21148	21153	100 %	0 %	0 %	0 %	328949560
559	NC_015387	CCA	2	6	21156	21161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949560
560	NC_015387	G	7	7	21220	21226	0 %	0 %	100 %	0 %	328949560
561	NC_015387	TGT	2	6	21230	21235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949560
562	NC_015387	ACC	2	6	21238	21243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949560
563	NC_015387	GGA	2	6	21273	21278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949560
564	NC_015387	C	6	6	21315	21320	0 %	0 %	0 %	100 %	328949560
565	NC_015387	C	6	6	21322	21327	0 %	0 %	0 %	100 %	328949560
566	NC_015387	AGC	2	6	21365	21370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949560
567	NC_015387	CGC	2	6	21387	21392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949560
568	NC_015387	GGA	2	6	21408	21413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949560
569	NC_015387	C	6	6	21426	21431	0 %	0 %	0 %	100 %	328949560
570	NC_015387	TCT	2	6	21578	21583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949560
571	NC_015387	GGA	2	6	21594	21599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949560
572	NC_015387	AGG	2	6	21614	21619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949560
573	NC_015387	TCG	2	6	21623	21628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949560
574	NC_015387	G	6	6	21695	21700	0 %	0 %	100 %	0 %	328949560
575	NC_015387	GAAG	2	8	21702	21709	50 %	0 %	50 %	0 %	328949560
576	NC_015387	GC	3	6	21754	21759	0 %	0 %	50 %	50 %	328949560
577	NC_015387	CGGG	2	8	21791	21798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
578	NC_015387	CCCG	2	8	21806	21813	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
579	NC_015387	AGG	2	6	21871	21876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949561
580	NC_015387	CGGG	2	8	21950	21957	0 %	0 %	75 %	25 %	328949561
581	NC_015387	ATC	2	6	21985	21990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949561
582	NC_015387	GCCGAG	2	12	22020	22031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328949561
583	NC_015387	GGC	2	6	22041	22046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949561
584	NC_015387	GAT	2	6	22086	22091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949561
585	NC_015387	GAA	2	6	22125	22130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949561
586	NC_015387	GCG	2	6	22162	22167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949561
587	NC_015387	CGC	2	6	22202	22207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949561
588	NC_015387	GCGATC	2	12	22243	22254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949561
589	NC_015387	ATG	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949561
590	NC_015387	CGCC	2	8	22363	22370	0 %	0 %	25 %	75 %	328949561
591	NC_015387	GAA	2	6	22371	22376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949561
592	NC_015387	CGA	2	6	22391	22396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949561
593	NC_015387	CGC	2	6	22490	22495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949561
594	NC_015387	G	6	6	22524	22529	0 %	0 %	100 %	0 %	328949561
595	NC_015387	GCCC	2	8	22548	22555	0 %	0 %	25 %	75 %	328949561
596	NC_015387	GCG	2	6	22580	22585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949561
597	NC_015387	CGA	2	6	22586	22591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949561
598	NC_015387	CCT	2	6	22640	22645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949561
599	NC_015387	GC	3	6	22675	22680	0 %	0 %	50 %	50 %	328949561
600	NC_015387	GAC	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949561
601	NC_015387	TGCT	2	8	22833	22840	0 %	50 %	25 %	25 %	328949561
602	NC_015387	C	6	6	22850	22855	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
603	NC_015387	CCA	2	6	22883	22888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949562
604	NC_015387	CCA	2	6	22904	22909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949562
605	NC_015387	CCG	2	6	22934	22939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949562
606	NC_015387	CGG	2	6	22982	22987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949562
607	NC_015387	GGC	2	6	22992	22997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949562
608	NC_015387	GAC	2	6	23037	23042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949562
609	NC_015387	GAG	2	6	23052	23057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
610	NC_015387	TGA	2	6	23084	23089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949562
611	NC_015387	CG	3	6	23110	23115	0 %	0 %	50 %	50 %	328949562
612	NC_015387	CAC	2	6	23127	23132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949562
613	NC_015387	GC	4	8	23152	23159	0 %	0 %	50 %	50 %	328949562
614	NC_015387	AGG	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
615	NC_015387	GC	3	6	23222	23227	0 %	0 %	50 %	50 %	328949562
616	NC_015387	AGA	2	6	23282	23287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949562
617	NC_015387	GCCG	2	8	23294	23301	0 %	0 %	50 %	50 %	328949562
618	NC_015387	AGG	2	6	23305	23310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
619	NC_015387	CGG	2	6	23351	23356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949562
620	NC_015387	GA	3	6	23380	23385	50 %	0 %	50 %	0 %	328949562
621	NC_015387	CAGGCC	2	12	23400	23411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328949562
622	NC_015387	GAG	2	6	23427	23432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
623	NC_015387	ATG	2	6	23470	23475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949562
624	NC_015387	GAA	2	6	23562	23567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949562
625	NC_015387	T	6	6	23604	23609	0 %	100 %	0 %	0 %	328949562
626	NC_015387	TGG	2	6	23612	23617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949562
627	NC_015387	GGA	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
628	NC_015387	GAC	2	6	23694	23699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949562
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630	NC_015387	GAG	2	6	23796	23801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949562
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